Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK2

Rrp1b, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1bQ91YK2 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rrp1bQ91YK2 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rrp1bQ91YK2 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rrp1bQ91YK2 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rrp1bQ91YK2 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrp1bQ91YK2 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrp1bQ91YK2 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrp1bQ91YK2 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrp1bQ91YK2 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrp1bQ91YK2 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrp1bQ91YK2 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrp1bQ91YK2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrp1bQ91YK2 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrp1bQ91YK2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrp1bQ91YK2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrp1bQ91YK2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrp1bQ91YK2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrp1bQ91YK2 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrp1bQ91YK2 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrp1bQ91YK2 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrp1bQ91YK2 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrp1bQ91YK2 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrp1bQ91YK2 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrp1bQ91YK2 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrp1bQ91YK2 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrp1bQ91YK2 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrp1bQ91YK2 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrp1bQ91YK2 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrp1bQ91YK2 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrp1bQ91YK2 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrp1bQ91YK2 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrp1bQ91YK2 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrp1bQ91YK2 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrp1bQ91YK2 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrp1bQ91YK2 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrp1bQ91YK2 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrp1bQ91YK2 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrp1bQ91YK2 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrp1bQ91YK2 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrp1bQ91YK2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrp1bQ91YK2 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrp1bQ91YK2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrp1bQ91YK2 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrp1bQ91YK2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrp1bQ91YK2 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrp1bQ91YK2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrp1bQ91YK2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrp1bQ91YK2 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrp1bQ91YK2 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrp1bQ91YK2 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrp1bQ91YK2 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrp1bQ91YK2 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrp1bQ91YK2 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrp1bQ91YK2 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rrp1bQ91YK2 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rrp1bQ91YK2 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rrp1bQ91YK2 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rrp1bQ91YK2 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rrp1bQ91YK2 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rrp1bQ91YK2 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms