Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH7

Rdh10, Retinol dehydrogenase 10, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh10Q8VCH7 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rdh10Q8VCH7 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rdh10Q8VCH7 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rdh10Q8VCH7 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rdh10Q8VCH7 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh10Q8VCH7 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh10Q8VCH7 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh10Q8VCH7 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh10Q8VCH7 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh10Q8VCH7 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh10Q8VCH7 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh10Q8VCH7 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh10Q8VCH7 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh10Q8VCH7 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh10Q8VCH7 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh10Q8VCH7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh10Q8VCH7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh10Q8VCH7 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh10Q8VCH7 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh10Q8VCH7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh10Q8VCH7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh10Q8VCH7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh10Q8VCH7 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh10Q8VCH7 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh10Q8VCH7 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh10Q8VCH7 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh10Q8VCH7 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh10Q8VCH7 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh10Q8VCH7 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh10Q8VCH7 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh10Q8VCH7 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh10Q8VCH7 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh10Q8VCH7 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh10Q8VCH7 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh10Q8VCH7 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh10Q8VCH7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh10Q8VCH7 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rdh10Q8VCH7 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rdh10Q8VCH7 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rdh10Q8VCH7 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rdh10Q8VCH7 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rdh10Q8VCH7 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rdh10Q8VCH7 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rdh10Q8VCH7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rdh10Q8VCH7 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rdh10Q8VCH7 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rdh10Q8VCH7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rdh10Q8VCH7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rdh10Q8VCH7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rdh10Q8VCH7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rdh10Q8VCH7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rdh10Q8VCH7 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rdh10Q8VCH7 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rdh10Q8VCH7 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rdh10Q8VCH7 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rdh10Q8VCH7 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rdh10Q8VCH7 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rdh10Q8VCH7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rdh10Q8VCH7 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rdh10Q8VCH7 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rdh10Q8VCH7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rdh10Q8VCH7 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rdh10Q8VCH7 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rdh10Q8VCH7 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rdh10Q8VCH7 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rdh10Q8VCH7 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rdh10Q8VCH7 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rdh10Q8VCH7 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rdh10Q8VCH7 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rdh10Q8VCH7 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rdh10Q8VCH7 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rdh10Q8VCH7 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rdh10Q8VCH7 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rdh10Q8VCH7 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rdh10Q8VCH7 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rdh10Q8VCH7 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rdh10Q8VCH7 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rdh10Q8VCH7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rdh10Q8VCH7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rdh10Q8VCH7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rdh10Q8VCH7 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rdh10Q8VCH7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rdh10Q8VCH7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rdh10Q8VCH7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rdh10Q8VCH7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rdh10Q8VCH7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rdh10Q8VCH7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rdh10Q8VCH7 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rdh10Q8VCH7 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rdh10Q8VCH7 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rdh10Q8VCH7 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rdh10Q8VCH7 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rdh10Q8VCH7 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rdh10Q8VCH7 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rdh10Q8VCH7 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rdh10Q8VCH7 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rdh10Q8VCH7 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rdh10Q8VCH7 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rdh10Q8VCH7 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rdh10Q8VCH7 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms