Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC56

Rnf8, E3 ubiquitin-protein ligase RNF8, mousemouse

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Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf8Q8VC56 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf8Q8VC56 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf8Q8VC56 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf8Q8VC56 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf8Q8VC56 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf8Q8VC56 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf8Q8VC56 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf8Q8VC56 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf8Q8VC56 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf8Q8VC56 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf8Q8VC56 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf8Q8VC56 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf8Q8VC56 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf8Q8VC56 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf8Q8VC56 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf8Q8VC56 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf8Q8VC56 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf8Q8VC56 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf8Q8VC56 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf8Q8VC56 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf8Q8VC56 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf8Q8VC56 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf8Q8VC56 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf8Q8VC56 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf8Q8VC56 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf8Q8VC56 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf8Q8VC56 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf8Q8VC56 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf8Q8VC56 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf8Q8VC56 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf8Q8VC56 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf8Q8VC56 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf8Q8VC56 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf8Q8VC56 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf8Q8VC56 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf8Q8VC56 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf8Q8VC56 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf8Q8VC56 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf8Q8VC56 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf8Q8VC56 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf8Q8VC56 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf8Q8VC56 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf8Q8VC56 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf8Q8VC56 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf8Q8VC56 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf8Q8VC56 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf8Q8VC56 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf8Q8VC56 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Rnf8Q8VC56 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf8Q8VC56 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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