Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc12Q8R344 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms