Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3N7

Vmn1r72, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r72Q8K3N7 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r72Q8K3N7 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r72Q8K3N7 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r72Q8K3N7 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r72Q8K3N7 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r72Q8K3N7 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r72Q8K3N7 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r72Q8K3N7 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r72Q8K3N7 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r72Q8K3N7 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r72Q8K3N7 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r72Q8K3N7 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r72Q8K3N7 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r72Q8K3N7 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r72Q8K3N7 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r72Q8K3N7 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r72Q8K3N7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r72Q8K3N7 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r72Q8K3N7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r72Q8K3N7 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r72Q8K3N7 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r72Q8K3N7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r72Q8K3N7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r72Q8K3N7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r72Q8K3N7 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r72Q8K3N7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r72Q8K3N7 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r72Q8K3N7 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r72Q8K3N7 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r72Q8K3N7 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r72Q8K3N7 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r72Q8K3N7 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r72Q8K3N7 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r72Q8K3N7 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r72Q8K3N7 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r72Q8K3N7 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Vmn1r72Q8K3N7 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Vmn1r72Q8K3N7 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Vmn1r72Q8K3N7 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Vmn1r72Q8K3N7 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Vmn1r72Q8K3N7 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Vmn1r72Q8K3N7 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Vmn1r72Q8K3N7 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r72Q8K3N7 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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