Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
MyripQ8K3I4 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms