Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrtm1Q8K377 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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