Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
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Abcf3Q8K268 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Abcf3Q8K268 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcf3Q8K268 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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