Protein–RNA interactions for Protein: Q8K212

Pacs1, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs1Q8K212 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pacs1Q8K212 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pacs1Q8K212 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pacs1Q8K212 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pacs1Q8K212 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pacs1Q8K212 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pacs1Q8K212 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pacs1Q8K212 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pacs1Q8K212 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pacs1Q8K212 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pacs1Q8K212 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pacs1Q8K212 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pacs1Q8K212 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pacs1Q8K212 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pacs1Q8K212 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pacs1Q8K212 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pacs1Q8K212 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pacs1Q8K212 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pacs1Q8K212 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pacs1Q8K212 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pacs1Q8K212 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pacs1Q8K212 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pacs1Q8K212 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pacs1Q8K212 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pacs1Q8K212 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pacs1Q8K212 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pacs1Q8K212 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pacs1Q8K212 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pacs1Q8K212 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pacs1Q8K212 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pacs1Q8K212 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pacs1Q8K212 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pacs1Q8K212 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pacs1Q8K212 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pacs1Q8K212 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pacs1Q8K212 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pacs1Q8K212 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pacs1Q8K212 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pacs1Q8K212 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pacs1Q8K212 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pacs1Q8K212 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pacs1Q8K212 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pacs1Q8K212 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pacs1Q8K212 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pacs1Q8K212 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pacs1Q8K212 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pacs1Q8K212 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pacs1Q8K212 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pacs1Q8K212 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pacs1Q8K212 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pacs1Q8K212 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pacs1Q8K212 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pacs1Q8K212 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pacs1Q8K212 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pacs1Q8K212 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pacs1Q8K212 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pacs1Q8K212 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pacs1Q8K212 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pacs1Q8K212 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pacs1Q8K212 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pacs1Q8K212 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pacs1Q8K212 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pacs1Q8K212 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pacs1Q8K212 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pacs1Q8K212 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pacs1Q8K212 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pacs1Q8K212 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pacs1Q8K212 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pacs1Q8K212 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pacs1Q8K212 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pacs1Q8K212 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pacs1Q8K212 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pacs1Q8K212 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Pacs1Q8K212 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pacs1Q8K212 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pacs1Q8K212 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pacs1Q8K212 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pacs1Q8K212 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pacs1Q8K212 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pacs1Q8K212 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pacs1Q8K212 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pacs1Q8K212 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pacs1Q8K212 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pacs1Q8K212 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pacs1Q8K212 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pacs1Q8K212 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pacs1Q8K212 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pacs1Q8K212 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pacs1Q8K212 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pacs1Q8K212 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pacs1Q8K212 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pacs1Q8K212 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pacs1Q8K212 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pacs1Q8K212 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pacs1Q8K212 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pacs1Q8K212 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pacs1Q8K212 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pacs1Q8K212 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pacs1Q8K212 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pacs1Q8K212 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms