Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW5

Sh2d5, SH2 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d5Q8JZW5 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d5Q8JZW5 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms