Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEE7

Rdh13, Retinol dehydrogenase 13, mousemouse

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Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh13Q8CEE7 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Rdh13Q8CEE7 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Rdh13Q8CEE7 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Rdh13Q8CEE7 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Rdh13Q8CEE7 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Rdh13Q8CEE7 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Rdh13Q8CEE7 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Rdh13Q8CEE7 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rdh13Q8CEE7 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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