Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE20

9030612E09Rik, RIKEN cDNA 9030612E09, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9030612E09RikQ8CE20 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
9030612E09RikQ8CE20 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms