Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc17Q8CE13 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc17Q8CE13 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc17Q8CE13 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc17Q8CE13 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc17Q8CE13 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc17Q8CE13 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc17Q8CE13 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc17Q8CE13 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc17Q8CE13 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc17Q8CE13 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc17Q8CE13 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc17Q8CE13 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc17Q8CE13 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc17Q8CE13 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc17Q8CE13 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc17Q8CE13 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc17Q8CE13 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc17Q8CE13 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc17Q8CE13 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc17Q8CE13 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc17Q8CE13 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc17Q8CE13 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc17Q8CE13 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc17Q8CE13 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc17Q8CE13 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc17Q8CE13 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc17Q8CE13 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc17Q8CE13 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc17Q8CE13 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc17Q8CE13 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc17Q8CE13 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc17Q8CE13 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc17Q8CE13 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc17Q8CE13 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc17Q8CE13 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms