Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc87Q8CDL9 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc87Q8CDL9 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms