Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD94

Lin52, Protein lin-52 homolog, mousemouse

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin52Q8CD94 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin52Q8CD94 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin52Q8CD94 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin52Q8CD94 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin52Q8CD94 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin52Q8CD94 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin52Q8CD94 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin52Q8CD94 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin52Q8CD94 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin52Q8CD94 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin52Q8CD94 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin52Q8CD94 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin52Q8CD94 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin52Q8CD94 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin52Q8CD94 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin52Q8CD94 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin52Q8CD94 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin52Q8CD94 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin52Q8CD94 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin52Q8CD94 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin52Q8CD94 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin52Q8CD94 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin52Q8CD94 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin52Q8CD94 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin52Q8CD94 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin52Q8CD94 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin52Q8CD94 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin52Q8CD94 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin52Q8CD94 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin52Q8CD94 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin52Q8CD94 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin52Q8CD94 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin52Q8CD94 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin52Q8CD94 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin52Q8CD94 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin52Q8CD94 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin52Q8CD94 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin52Q8CD94 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin52Q8CD94 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin52Q8CD94 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin52Q8CD94 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin52Q8CD94 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin52Q8CD94 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin52Q8CD94 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin52Q8CD94 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin52Q8CD94 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin52Q8CD94 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin52Q8CD94 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin52Q8CD94 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin52Q8CD94 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin52Q8CD94 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin52Q8CD94 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin52Q8CD94 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin52Q8CD94 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin52Q8CD94 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin52Q8CD94 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin52Q8CD94 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin52Q8CD94 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin52Q8CD94 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin52Q8CD94 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin52Q8CD94 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin52Q8CD94 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin52Q8CD94 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin52Q8CD94 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin52Q8CD94 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin52Q8CD94 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lin52Q8CD94 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lin52Q8CD94 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lin52Q8CD94 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Lin52Q8CD94 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lin52Q8CD94 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lin52Q8CD94 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Lin52Q8CD94 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lin52Q8CD94 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lin52Q8CD94 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lin52Q8CD94 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Lin52Q8CD94 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lin52Q8CD94 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lin52Q8CD94 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lin52Q8CD94 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lin52Q8CD94 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lin52Q8CD94 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lin52Q8CD94 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lin52Q8CD94 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lin52Q8CD94 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lin52Q8CD94 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lin52Q8CD94 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lin52Q8CD94 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin52Q8CD94 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin52Q8CD94 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin52Q8CD94 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin52Q8CD94 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin52Q8CD94 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin52Q8CD94 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin52Q8CD94 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin52Q8CD94 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin52Q8CD94 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin52Q8CD94 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lin52Q8CD94 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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