Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
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Fbxo48Q8CAT8 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxo48Q8CAT8 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms