Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL9

Iffo1, Intermediate filament family orphan 1, mousemouse

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Length 562 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iffo1Q8BXL9 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Iffo1Q8BXL9 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Iffo1Q8BXL9 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Iffo1Q8BXL9 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Iffo1Q8BXL9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Iffo1Q8BXL9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Iffo1Q8BXL9 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Iffo1Q8BXL9 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Iffo1Q8BXL9 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Iffo1Q8BXL9 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Iffo1Q8BXL9 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Iffo1Q8BXL9 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Iffo1Q8BXL9 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Iffo1Q8BXL9 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Iffo1Q8BXL9 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Iffo1Q8BXL9 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Iffo1Q8BXL9 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Iffo1Q8BXL9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Iffo1Q8BXL9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Iffo1Q8BXL9 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Iffo1Q8BXL9 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Iffo1Q8BXL9 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Iffo1Q8BXL9 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Iffo1Q8BXL9 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Iffo1Q8BXL9 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Iffo1Q8BXL9 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Iffo1Q8BXL9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Iffo1Q8BXL9 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Iffo1Q8BXL9 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Iffo1Q8BXL9 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Iffo1Q8BXL9 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Iffo1Q8BXL9 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Iffo1Q8BXL9 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Iffo1Q8BXL9 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Iffo1Q8BXL9 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Iffo1Q8BXL9 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Iffo1Q8BXL9 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Iffo1Q8BXL9 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Iffo1Q8BXL9 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Iffo1Q8BXL9 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Iffo1Q8BXL9 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Iffo1Q8BXL9 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Iffo1Q8BXL9 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Iffo1Q8BXL9 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Iffo1Q8BXL9 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Iffo1Q8BXL9 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Iffo1Q8BXL9 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Iffo1Q8BXL9 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Iffo1Q8BXL9 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Iffo1Q8BXL9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Iffo1Q8BXL9 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Iffo1Q8BXL9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Iffo1Q8BXL9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Iffo1Q8BXL9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Iffo1Q8BXL9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Iffo1Q8BXL9 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Iffo1Q8BXL9 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Iffo1Q8BXL9 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Iffo1Q8BXL9 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Iffo1Q8BXL9 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Iffo1Q8BXL9 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Iffo1Q8BXL9 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Iffo1Q8BXL9 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Iffo1Q8BXL9 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Iffo1Q8BXL9 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Iffo1Q8BXL9 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Iffo1Q8BXL9 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Iffo1Q8BXL9 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Iffo1Q8BXL9 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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