Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube3dQ8BX13 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms