Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Ctdsp2Q8BX07 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Ctdsp2Q8BX07 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Ctdsp2Q8BX07 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Ctdsp2Q8BX07 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Ctdsp2Q8BX07 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Ctdsp2Q8BX07 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ctdsp2Q8BX07 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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