Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx17Q8BVL3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx17Q8BVL3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx17Q8BVL3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx17Q8BVL3 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx17Q8BVL3 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx17Q8BVL3 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx17Q8BVL3 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx17Q8BVL3 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx17Q8BVL3 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx17Q8BVL3 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx17Q8BVL3 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx17Q8BVL3 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx17Q8BVL3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx17Q8BVL3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx17Q8BVL3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx17Q8BVL3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx17Q8BVL3 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx17Q8BVL3 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx17Q8BVL3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx17Q8BVL3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx17Q8BVL3 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx17Q8BVL3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx17Q8BVL3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx17Q8BVL3 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx17Q8BVL3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx17Q8BVL3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx17Q8BVL3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx17Q8BVL3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx17Q8BVL3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx17Q8BVL3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx17Q8BVL3 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx17Q8BVL3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx17Q8BVL3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx17Q8BVL3 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx17Q8BVL3 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx17Q8BVL3 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx17Q8BVL3 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx17Q8BVL3 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx17Q8BVL3 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx17Q8BVL3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx17Q8BVL3 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx17Q8BVL3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx17Q8BVL3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx17Q8BVL3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx17Q8BVL3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx17Q8BVL3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx17Q8BVL3 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx17Q8BVL3 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx17Q8BVL3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx17Q8BVL3 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx17Q8BVL3 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx17Q8BVL3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx17Q8BVL3 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx17Q8BVL3 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx17Q8BVL3 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx17Q8BVL3 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx17Q8BVL3 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx17Q8BVL3 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx17Q8BVL3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx17Q8BVL3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx17Q8BVL3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx17Q8BVL3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx17Q8BVL3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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