Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLI4

Dse, Dermatan-sulfate epimerase, mousemouse

Predictions only

Length 958 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DseQ8BLI4 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DseQ8BLI4 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DseQ8BLI4 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DseQ8BLI4 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DseQ8BLI4 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DseQ8BLI4 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DseQ8BLI4 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DseQ8BLI4 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DseQ8BLI4 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DseQ8BLI4 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DseQ8BLI4 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DseQ8BLI4 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DseQ8BLI4 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DseQ8BLI4 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DseQ8BLI4 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DseQ8BLI4 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DseQ8BLI4 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DseQ8BLI4 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DseQ8BLI4 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DseQ8BLI4 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DseQ8BLI4 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DseQ8BLI4 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DseQ8BLI4 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DseQ8BLI4 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DseQ8BLI4 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DseQ8BLI4 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DseQ8BLI4 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DseQ8BLI4 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DseQ8BLI4 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DseQ8BLI4 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DseQ8BLI4 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DseQ8BLI4 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DseQ8BLI4 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DseQ8BLI4 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DseQ8BLI4 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DseQ8BLI4 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DseQ8BLI4 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DseQ8BLI4 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DseQ8BLI4 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DseQ8BLI4 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DseQ8BLI4 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
DseQ8BLI4 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DseQ8BLI4 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DseQ8BLI4 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DseQ8BLI4 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DseQ8BLI4 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DseQ8BLI4 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DseQ8BLI4 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DseQ8BLI4 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DseQ8BLI4 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DseQ8BLI4 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DseQ8BLI4 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DseQ8BLI4 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DseQ8BLI4 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DseQ8BLI4 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DseQ8BLI4 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DseQ8BLI4 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DseQ8BLI4 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DseQ8BLI4 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DseQ8BLI4 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DseQ8BLI4 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DseQ8BLI4 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DseQ8BLI4 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DseQ8BLI4 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DseQ8BLI4 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
DseQ8BLI4 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DseQ8BLI4 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DseQ8BLI4 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DseQ8BLI4 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DseQ8BLI4 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DseQ8BLI4 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DseQ8BLI4 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DseQ8BLI4 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DseQ8BLI4 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DseQ8BLI4 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DseQ8BLI4 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DseQ8BLI4 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DseQ8BLI4 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DseQ8BLI4 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DseQ8BLI4 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DseQ8BLI4 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DseQ8BLI4 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DseQ8BLI4 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DseQ8BLI4 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DseQ8BLI4 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DseQ8BLI4 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DseQ8BLI4 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DseQ8BLI4 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DseQ8BLI4 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DseQ8BLI4 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DseQ8BLI4 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DseQ8BLI4 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DseQ8BLI4 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DseQ8BLI4 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DseQ8BLI4 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DseQ8BLI4 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DseQ8BLI4 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DseQ8BLI4 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DseQ8BLI4 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DseQ8BLI4 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 283.2 ms