Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Zbed4Q80WQ9 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Zbed4Q80WQ9 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Zbed4Q80WQ9 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Zbed4Q80WQ9 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Zbed4Q80WQ9 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Zbed4Q80WQ9 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
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Zbed4Q80WQ9 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zbed4Q80WQ9 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zbed4Q80WQ9 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Zbed4Q80WQ9 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
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Zbed4Q80WQ9 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Zbed4Q80WQ9 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zbed4Q80WQ9 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Zbed4Q80WQ9 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zbed4Q80WQ9 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zbed4Q80WQ9 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zbed4Q80WQ9 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Zbed4Q80WQ9 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zbed4Q80WQ9 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zbed4Q80WQ9 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Zbed4Q80WQ9 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zbed4Q80WQ9 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zbed4Q80WQ9 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zbed4Q80WQ9 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Zbed4Q80WQ9 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms