Protein–RNA interactions for Protein: Q80U87

Usp8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,080 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp8Q80U87 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp8Q80U87 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp8Q80U87 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp8Q80U87 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp8Q80U87 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp8Q80U87 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp8Q80U87 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp8Q80U87 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp8Q80U87 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp8Q80U87 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Usp8Q80U87 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Usp8Q80U87 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Usp8Q80U87 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp8Q80U87 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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