Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSL0

Ifnk, Interferon kappa, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnkQ7TSL0 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
IfnkQ7TSL0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
IfnkQ7TSL0 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IfnkQ7TSL0 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
IfnkQ7TSL0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
IfnkQ7TSL0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IfnkQ7TSL0 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IfnkQ7TSL0 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
IfnkQ7TSL0 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IfnkQ7TSL0 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IfnkQ7TSL0 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IfnkQ7TSL0 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IfnkQ7TSL0 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
IfnkQ7TSL0 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IfnkQ7TSL0 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IfnkQ7TSL0 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IfnkQ7TSL0 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IfnkQ7TSL0 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
IfnkQ7TSL0 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IfnkQ7TSL0 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IfnkQ7TSL0 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IfnkQ7TSL0 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IfnkQ7TSL0 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IfnkQ7TSL0 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
IfnkQ7TSL0 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
IfnkQ7TSL0 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
IfnkQ7TSL0 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IfnkQ7TSL0 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
IfnkQ7TSL0 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IfnkQ7TSL0 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
IfnkQ7TSL0 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
IfnkQ7TSL0 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
IfnkQ7TSL0 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IfnkQ7TSL0 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IfnkQ7TSL0 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IfnkQ7TSL0 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IfnkQ7TSL0 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IfnkQ7TSL0 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IfnkQ7TSL0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IfnkQ7TSL0 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IfnkQ7TSL0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IfnkQ7TSL0 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IfnkQ7TSL0 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IfnkQ7TSL0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
IfnkQ7TSL0 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IfnkQ7TSL0 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IfnkQ7TSL0 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IfnkQ7TSL0 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IfnkQ7TSL0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IfnkQ7TSL0 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
IfnkQ7TSL0 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IfnkQ7TSL0 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IfnkQ7TSL0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IfnkQ7TSL0 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IfnkQ7TSL0 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IfnkQ7TSL0 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IfnkQ7TSL0 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IfnkQ7TSL0 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IfnkQ7TSL0 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IfnkQ7TSL0 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IfnkQ7TSL0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IfnkQ7TSL0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IfnkQ7TSL0 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IfnkQ7TSL0 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IfnkQ7TSL0 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IfnkQ7TSL0 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IfnkQ7TSL0 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IfnkQ7TSL0 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IfnkQ7TSL0 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IfnkQ7TSL0 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IfnkQ7TSL0 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IfnkQ7TSL0 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IfnkQ7TSL0 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IfnkQ7TSL0 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IfnkQ7TSL0 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IfnkQ7TSL0 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IfnkQ7TSL0 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IfnkQ7TSL0 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IfnkQ7TSL0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
IfnkQ7TSL0 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
IfnkQ7TSL0 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
IfnkQ7TSL0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IfnkQ7TSL0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IfnkQ7TSL0 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IfnkQ7TSL0 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IfnkQ7TSL0 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IfnkQ7TSL0 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IfnkQ7TSL0 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IfnkQ7TSL0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IfnkQ7TSL0 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IfnkQ7TSL0 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IfnkQ7TSL0 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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