Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctdp1Q7TSG2 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms