Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap2lQ7TS74 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms