Protein–RNA interactions for Protein: Q7M729

Scn4b, Sodium channel subunit beta-4, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4bQ7M729 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Scn4bQ7M729 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Scn4bQ7M729 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Scn4bQ7M729 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Scn4bQ7M729 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Scn4bQ7M729 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Scn4bQ7M729 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Scn4bQ7M729 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Scn4bQ7M729 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Scn4bQ7M729 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Scn4bQ7M729 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Scn4bQ7M729 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Scn4bQ7M729 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Scn4bQ7M729 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Scn4bQ7M729 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Scn4bQ7M729 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Scn4bQ7M729 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Scn4bQ7M729 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn4bQ7M729 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn4bQ7M729 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Scn4bQ7M729 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn4bQ7M729 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn4bQ7M729 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn4bQ7M729 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Scn4bQ7M729 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn4bQ7M729 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn4bQ7M729 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn4bQ7M729 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn4bQ7M729 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn4bQ7M729 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn4bQ7M729 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn4bQ7M729 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn4bQ7M729 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn4bQ7M729 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn4bQ7M729 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn4bQ7M729 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn4bQ7M729 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn4bQ7M729 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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