Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tmed3Q78IS1 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms