Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja6Q6S5G4 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms