Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSQ5

Sp140, Sp140 nuclear body protein, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp140Q6NSQ5 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Sp140Q6NSQ5 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp140Q6NSQ5 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms