Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
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Tpm4Q6IRU2 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Tpm4Q6IRU2 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tpm4Q6IRU2 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms