Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX2

Krt42, Keratin, type I cytoskeletal 42, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt42Q6IFX2 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt42Q6IFX2 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt42Q6IFX2 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt42Q6IFX2 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt42Q6IFX2 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt42Q6IFX2 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt42Q6IFX2 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt42Q6IFX2 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt42Q6IFX2 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt42Q6IFX2 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt42Q6IFX2 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt42Q6IFX2 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt42Q6IFX2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt42Q6IFX2 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt42Q6IFX2 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt42Q6IFX2 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt42Q6IFX2 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt42Q6IFX2 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt42Q6IFX2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt42Q6IFX2 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt42Q6IFX2 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt42Q6IFX2 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt42Q6IFX2 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt42Q6IFX2 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt42Q6IFX2 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt42Q6IFX2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt42Q6IFX2 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt42Q6IFX2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt42Q6IFX2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt42Q6IFX2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt42Q6IFX2 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt42Q6IFX2 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt42Q6IFX2 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt42Q6IFX2 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt42Q6IFX2 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt42Q6IFX2 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt42Q6IFX2 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt42Q6IFX2 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt42Q6IFX2 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt42Q6IFX2 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt42Q6IFX2 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt42Q6IFX2 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt42Q6IFX2 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt42Q6IFX2 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt42Q6IFX2 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt42Q6IFX2 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt42Q6IFX2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt42Q6IFX2 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt42Q6IFX2 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt42Q6IFX2 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt42Q6IFX2 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt42Q6IFX2 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt42Q6IFX2 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt42Q6IFX2 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt42Q6IFX2 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt42Q6IFX2 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt42Q6IFX2 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt42Q6IFX2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt42Q6IFX2 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt42Q6IFX2 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt42Q6IFX2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt42Q6IFX2 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt42Q6IFX2 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt42Q6IFX2 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt42Q6IFX2 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt42Q6IFX2 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt42Q6IFX2 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt42Q6IFX2 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt42Q6IFX2 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt42Q6IFX2 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt42Q6IFX2 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Krt42Q6IFX2 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Krt42Q6IFX2 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Krt42Q6IFX2 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Krt42Q6IFX2 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt42Q6IFX2 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt42Q6IFX2 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt42Q6IFX2 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt42Q6IFX2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt42Q6IFX2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt42Q6IFX2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt42Q6IFX2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt42Q6IFX2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt42Q6IFX2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt42Q6IFX2 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt42Q6IFX2 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt42Q6IFX2 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt42Q6IFX2 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt42Q6IFX2 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt42Q6IFX2 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt42Q6IFX2 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt42Q6IFX2 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt42Q6IFX2 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt42Q6IFX2 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt42Q6IFX2 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt42Q6IFX2 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt42Q6IFX2 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt42Q6IFX2 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt42Q6IFX2 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt42Q6IFX2 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms