Protein–RNA interactions for Protein: Q64519

Sdc3, Syndecan-3, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Sdc3Q64519 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdc3Q64519 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdc3Q64519 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdc3Q64519 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdc3Q64519 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdc3Q64519 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdc3Q64519 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdc3Q64519 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdc3Q64519 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdc3Q64519 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdc3Q64519 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdc3Q64519 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdc3Q64519 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdc3Q64519 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Sdc3Q64519 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Sdc3Q64519 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Sdc3Q64519 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sdc3Q64519 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sdc3Q64519 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sdc3Q64519 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sdc3Q64519 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sdc3Q64519 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sdc3Q64519 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Sdc3Q64519 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Sdc3Q64519 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Sdc3Q64519 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Sdc3Q64519 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdc3Q64519 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdc3Q64519 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdc3Q64519 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sdc3Q64519 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sdc3Q64519 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sdc3Q64519 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms