Protein–RNA interactions for Protein: Q63871

Polr2k, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2kQ63871 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Polr2kQ63871 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms