Protein–RNA interactions for Protein: Q62513

Znf260, Zinc finger protein 260, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf260Q62513 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Znf260Q62513 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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