Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sin3bQ62141 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sin3bQ62141 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms