Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Itga6Q61739 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itga6Q61739 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms