Protein–RNA interactions for Protein: Q61458

Ccnh, Cyclin-H, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnhQ61458 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcnhQ61458 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcnhQ61458 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcnhQ61458 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CcnhQ61458 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CcnhQ61458 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CcnhQ61458 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CcnhQ61458 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CcnhQ61458 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CcnhQ61458 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcnhQ61458 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CcnhQ61458 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcnhQ61458 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcnhQ61458 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcnhQ61458 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcnhQ61458 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CcnhQ61458 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcnhQ61458 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcnhQ61458 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcnhQ61458 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcnhQ61458 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcnhQ61458 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcnhQ61458 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CcnhQ61458 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CcnhQ61458 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcnhQ61458 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcnhQ61458 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcnhQ61458 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcnhQ61458 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcnhQ61458 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcnhQ61458 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcnhQ61458 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcnhQ61458 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcnhQ61458 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcnhQ61458 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcnhQ61458 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcnhQ61458 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcnhQ61458 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcnhQ61458 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcnhQ61458 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcnhQ61458 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcnhQ61458 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcnhQ61458 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcnhQ61458 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcnhQ61458 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcnhQ61458 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcnhQ61458 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcnhQ61458 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcnhQ61458 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcnhQ61458 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcnhQ61458 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcnhQ61458 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcnhQ61458 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcnhQ61458 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcnhQ61458 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcnhQ61458 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcnhQ61458 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcnhQ61458 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcnhQ61458 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcnhQ61458 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CcnhQ61458 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcnhQ61458 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcnhQ61458 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcnhQ61458 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcnhQ61458 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcnhQ61458 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcnhQ61458 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcnhQ61458 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcnhQ61458 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcnhQ61458 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcnhQ61458 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcnhQ61458 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcnhQ61458 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcnhQ61458 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcnhQ61458 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcnhQ61458 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcnhQ61458 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcnhQ61458 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcnhQ61458 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CcnhQ61458 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcnhQ61458 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcnhQ61458 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcnhQ61458 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcnhQ61458 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcnhQ61458 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcnhQ61458 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcnhQ61458 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcnhQ61458 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CcnhQ61458 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcnhQ61458 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcnhQ61458 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcnhQ61458 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcnhQ61458 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcnhQ61458 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcnhQ61458 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcnhQ61458 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcnhQ61458 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcnhQ61458 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcnhQ61458 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcnhQ61458 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms