Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Lamb3Q61087 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lamb3Q61087 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lamb3Q61087 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lamb3Q61087 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lamb3Q61087 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lamb3Q61087 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lamb3Q61087 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lamb3Q61087 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lamb3Q61087 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lamb3Q61087 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lamb3Q61087 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lamb3Q61087 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lamb3Q61087 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lamb3Q61087 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lamb3Q61087 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lamb3Q61087 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lamb3Q61087 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lamb3Q61087 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lamb3Q61087 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lamb3Q61087 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lamb3Q61087 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lamb3Q61087 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lamb3Q61087 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lamb3Q61087 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lamb3Q61087 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Lamb3Q61087 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lamb3Q61087 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lamb3Q61087 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lamb3Q61087 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lamb3Q61087 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lamb3Q61087 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lamb3Q61087 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lamb3Q61087 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lamb3Q61087 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Lamb3Q61087 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Lamb3Q61087 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Lamb3Q61087 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lamb3Q61087 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Lamb3Q61087 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lamb3Q61087 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lamb3Q61087 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lamb3Q61087 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lamb3Q61087 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lamb3Q61087 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lamb3Q61087 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lamb3Q61087 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Lamb3Q61087 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lamb3Q61087 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lamb3Q61087 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lamb3Q61087 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lamb3Q61087 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lamb3Q61087 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lamb3Q61087 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lamb3Q61087 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lamb3Q61087 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lamb3Q61087 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Lamb3Q61087 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lamb3Q61087 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lamb3Q61087 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lamb3Q61087 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lamb3Q61087 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lamb3Q61087 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lamb3Q61087 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lamb3Q61087 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lamb3Q61087 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lamb3Q61087 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lamb3Q61087 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lamb3Q61087 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lamb3Q61087 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lamb3Q61087 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lamb3Q61087 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lamb3Q61087 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lamb3Q61087 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lamb3Q61087 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lamb3Q61087 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lamb3Q61087 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lamb3Q61087 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Lamb3Q61087 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Lamb3Q61087 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lamb3Q61087 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lamb3Q61087 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lamb3Q61087 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lamb3Q61087 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lamb3Q61087 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lamb3Q61087 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lamb3Q61087 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lamb3Q61087 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lamb3Q61087 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lamb3Q61087 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lamb3Q61087 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lamb3Q61087 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lamb3Q61087 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lamb3Q61087 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lamb3Q61087 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms