Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp13a3Q5XF89 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp13a3Q5XF89 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp13a3Q5XF89 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp13a3Q5XF89 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp13a3Q5XF89 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp13a3Q5XF89 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp13a3Q5XF89 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp13a3Q5XF89 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp13a3Q5XF89 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp13a3Q5XF89 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp13a3Q5XF89 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp13a3Q5XF89 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp13a3Q5XF89 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp13a3Q5XF89 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp13a3Q5XF89 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp13a3Q5XF89 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp13a3Q5XF89 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp13a3Q5XF89 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp13a3Q5XF89 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp13a3Q5XF89 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp13a3Q5XF89 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp13a3Q5XF89 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp13a3Q5XF89 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp13a3Q5XF89 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp13a3Q5XF89 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp13a3Q5XF89 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atp13a3Q5XF89 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atp13a3Q5XF89 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atp13a3Q5XF89 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atp13a3Q5XF89 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atp13a3Q5XF89 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atp13a3Q5XF89 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atp13a3Q5XF89 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atp13a3Q5XF89 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp13a3Q5XF89 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms