Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
H2al1nQ497L1 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms