Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc114Q3UX62 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc114Q3UX62 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc114Q3UX62 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc114Q3UX62 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc114Q3UX62 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc114Q3UX62 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc114Q3UX62 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc114Q3UX62 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc114Q3UX62 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc114Q3UX62 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc114Q3UX62 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc114Q3UX62 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc114Q3UX62 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc114Q3UX62 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc114Q3UX62 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc114Q3UX62 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc114Q3UX62 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc114Q3UX62 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc114Q3UX62 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc114Q3UX62 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc114Q3UX62 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc114Q3UX62 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc114Q3UX62 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc114Q3UX62 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc114Q3UX62 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc114Q3UX62 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc114Q3UX62 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc114Q3UX62 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc114Q3UX62 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc114Q3UX62 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc114Q3UX62 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc114Q3UX62 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc114Q3UX62 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc114Q3UX62 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc114Q3UX62 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc114Q3UX62 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc114Q3UX62 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc114Q3UX62 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc114Q3UX62 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc114Q3UX62 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc114Q3UX62 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc114Q3UX62 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc114Q3UX62 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc114Q3UX62 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc114Q3UX62 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc114Q3UX62 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc114Q3UX62 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc114Q3UX62 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc114Q3UX62 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc114Q3UX62 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc114Q3UX62 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc114Q3UX62 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc114Q3UX62 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms