Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQI9

Mindy4, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-4, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy4Q3UQI9 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Mindy4Q3UQI9 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mindy4Q3UQI9 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Mindy4Q3UQI9 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mindy4Q3UQI9 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mindy4Q3UQI9 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mindy4Q3UQI9 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Mindy4Q3UQI9 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mindy4Q3UQI9 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mindy4Q3UQI9 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mindy4Q3UQI9 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mindy4Q3UQI9 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mindy4Q3UQI9 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mindy4Q3UQI9 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mindy4Q3UQI9 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mindy4Q3UQI9 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mindy4Q3UQI9 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mindy4Q3UQI9 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mindy4Q3UQI9 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mindy4Q3UQI9 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mindy4Q3UQI9 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mindy4Q3UQI9 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mindy4Q3UQI9 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mindy4Q3UQI9 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mindy4Q3UQI9 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mindy4Q3UQI9 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mindy4Q3UQI9 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mindy4Q3UQI9 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mindy4Q3UQI9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mindy4Q3UQI9 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mindy4Q3UQI9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mindy4Q3UQI9 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mindy4Q3UQI9 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mindy4Q3UQI9 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mindy4Q3UQI9 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mindy4Q3UQI9 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mindy4Q3UQI9 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mindy4Q3UQI9 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mindy4Q3UQI9 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mindy4Q3UQI9 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mindy4Q3UQI9 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mindy4Q3UQI9 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mindy4Q3UQI9 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mindy4Q3UQI9 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mindy4Q3UQI9 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mindy4Q3UQI9 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mindy4Q3UQI9 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mindy4Q3UQI9 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mindy4Q3UQI9 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mindy4Q3UQI9 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mindy4Q3UQI9 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mindy4Q3UQI9 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mindy4Q3UQI9 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mindy4Q3UQI9 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mindy4Q3UQI9 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mindy4Q3UQI9 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mindy4Q3UQI9 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mindy4Q3UQI9 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mindy4Q3UQI9 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Mindy4Q3UQI9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mindy4Q3UQI9 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Mindy4Q3UQI9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mindy4Q3UQI9 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mindy4Q3UQI9 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mindy4Q3UQI9 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mindy4Q3UQI9 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mindy4Q3UQI9 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mindy4Q3UQI9 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mindy4Q3UQI9 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mindy4Q3UQI9 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mindy4Q3UQI9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mindy4Q3UQI9 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mindy4Q3UQI9 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mindy4Q3UQI9 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mindy4Q3UQI9 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mindy4Q3UQI9 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mindy4Q3UQI9 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mindy4Q3UQI9 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mindy4Q3UQI9 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mindy4Q3UQI9 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mindy4Q3UQI9 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mindy4Q3UQI9 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mindy4Q3UQI9 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mindy4Q3UQI9 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mindy4Q3UQI9 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mindy4Q3UQI9 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mindy4Q3UQI9 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mindy4Q3UQI9 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mindy4Q3UQI9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mindy4Q3UQI9 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mindy4Q3UQI9 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Mindy4Q3UQI9 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mindy4Q3UQI9 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mindy4Q3UQI9 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mindy4Q3UQI9 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mindy4Q3UQI9 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mindy4Q3UQI9 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mindy4Q3UQI9 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mindy4Q3UQI9 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mindy4Q3UQI9 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms