Protein–RNA interactions for Protein: Q3U285

Lcorl, Ligand-dependent nuclear receptor corepressor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorlQ3U285 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LcorlQ3U285 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms