Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc174Q3U155 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc174Q3U155 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc174Q3U155 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc174Q3U155 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc174Q3U155 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc174Q3U155 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc174Q3U155 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc174Q3U155 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc174Q3U155 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc174Q3U155 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc174Q3U155 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc174Q3U155 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc174Q3U155 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc174Q3U155 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc174Q3U155 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc174Q3U155 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc174Q3U155 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc174Q3U155 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc174Q3U155 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc174Q3U155 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms