Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYV2

Hhla1, HERV-H LTR-associating protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hhla1Q3TYV2 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms