Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc136Q3TVA9 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms