Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLD5

Uri1, Unconventional prefoldin RPB5 interactor, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uri1Q3TLD5 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Uri1Q3TLD5 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Uri1Q3TLD5 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Uri1Q3TLD5 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Uri1Q3TLD5 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Uri1Q3TLD5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Uri1Q3TLD5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Uri1Q3TLD5 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Uri1Q3TLD5 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Uri1Q3TLD5 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Uri1Q3TLD5 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Uri1Q3TLD5 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uri1Q3TLD5 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uri1Q3TLD5 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uri1Q3TLD5 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uri1Q3TLD5 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uri1Q3TLD5 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uri1Q3TLD5 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uri1Q3TLD5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uri1Q3TLD5 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uri1Q3TLD5 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uri1Q3TLD5 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uri1Q3TLD5 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Uri1Q3TLD5 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Uri1Q3TLD5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Uri1Q3TLD5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uri1Q3TLD5 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uri1Q3TLD5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uri1Q3TLD5 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uri1Q3TLD5 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uri1Q3TLD5 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uri1Q3TLD5 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uri1Q3TLD5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uri1Q3TLD5 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uri1Q3TLD5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uri1Q3TLD5 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Uri1Q3TLD5 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Uri1Q3TLD5 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Uri1Q3TLD5 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Uri1Q3TLD5 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Uri1Q3TLD5 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Uri1Q3TLD5 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Uri1Q3TLD5 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Uri1Q3TLD5 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Uri1Q3TLD5 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Uri1Q3TLD5 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Uri1Q3TLD5 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Uri1Q3TLD5 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Uri1Q3TLD5 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Uri1Q3TLD5 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Uri1Q3TLD5 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Uri1Q3TLD5 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Uri1Q3TLD5 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Uri1Q3TLD5 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Uri1Q3TLD5 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Uri1Q3TLD5 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Uri1Q3TLD5 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Uri1Q3TLD5 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Uri1Q3TLD5 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Uri1Q3TLD5 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Uri1Q3TLD5 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Uri1Q3TLD5 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Uri1Q3TLD5 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Uri1Q3TLD5 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Uri1Q3TLD5 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Uri1Q3TLD5 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Uri1Q3TLD5 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uri1Q3TLD5 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uri1Q3TLD5 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uri1Q3TLD5 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uri1Q3TLD5 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uri1Q3TLD5 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uri1Q3TLD5 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uri1Q3TLD5 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uri1Q3TLD5 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uri1Q3TLD5 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uri1Q3TLD5 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uri1Q3TLD5 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uri1Q3TLD5 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uri1Q3TLD5 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uri1Q3TLD5 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uri1Q3TLD5 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Uri1Q3TLD5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uri1Q3TLD5 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uri1Q3TLD5 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uri1Q3TLD5 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uri1Q3TLD5 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uri1Q3TLD5 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uri1Q3TLD5 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uri1Q3TLD5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uri1Q3TLD5 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uri1Q3TLD5 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uri1Q3TLD5 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uri1Q3TLD5 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uri1Q3TLD5 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uri1Q3TLD5 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uri1Q3TLD5 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uri1Q3TLD5 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uri1Q3TLD5 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uri1Q3TLD5 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms