Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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Rpusd2Q149F1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpusd2Q149F1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpusd2Q149F1 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpusd2Q149F1 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpusd2Q149F1 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpusd2Q149F1 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpusd2Q149F1 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpusd2Q149F1 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpusd2Q149F1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpusd2Q149F1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpusd2Q149F1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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Rpusd2Q149F1 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpusd2Q149F1 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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Rpusd2Q149F1 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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Rpusd2Q149F1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
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Rpusd2Q149F1 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpusd2Q149F1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpusd2Q149F1 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpusd2Q149F1 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpusd2Q149F1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpusd2Q149F1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpusd2Q149F1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpusd2Q149F1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpusd2Q149F1 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rpusd2Q149F1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
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Rpusd2Q149F1 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rpusd2Q149F1 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
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Rpusd2Q149F1 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
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Rpusd2Q149F1 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
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Rpusd2Q149F1 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
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Rpusd2Q149F1 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
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Rpusd2Q149F1 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
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Rpusd2Q149F1 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
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Rpusd2Q149F1 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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Rpusd2Q149F1 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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Rpusd2Q149F1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
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Rpusd2Q149F1 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
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