Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Itgb8Q0VBD0 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms